Cụ thể, năm 2012, ngành Thuế đã thực hiện thanh tra, kiểm tra đối với 59.419 doanh nghiệp (tăng 18% so với năm 2011), xử lý truy thu, phạt và truy hoàn số tiền là 12.121 tỷ đồng (tăng 59% so với năm 2011), giảm lỗ 14.885 tỷ đồng (tăng 37% so với năm 2011).
Trong đó, các cơ quan thuế đã thanh tra, kiểm tra đối với 2.161 doanh nghiệp lỗ, doanh nghiệp có dấu hiệu chuyển giá, doanh nghiệp có hoạt động giao dịch liên kết, xác định lại doanh số của nhiều doanh nghiệp kê khai lỗ sang có lãi và kiến nghị xử lý truy thu, phạt, truy hoàn gần 747 tỷ đồng, giảm lỗ 4.776 tỷ đồng, giảm khấu trừ 144 tỷ đồng.
Bước sang năm 2013, ngành Thuế cũng đã thực hiện thanh tra, kiểm tra đối với 64.119 doanh nghiệp (tăng 8% so với năm 2012), xử lý truy thu, phạt và truy hoàn số tiền là 13.657 tỷ đồng (tăng 3,3% so với năm 2012), giảm lỗ 15.712 tỷ đồng (tăng 5,6% so với năm 2012).
Trong đó, các cơ quan thuế đã thanh tra, kiểm tra đối với 2.110 doanh nghiệp có giao dịch liên kết, liên tục khai lỗ nhưng vẫn đầu tư mở rộng sản xuất kinh doanh, kiến nghị xử lý truy thu, phạt, truy hoàn 988 tỷ đồng, giảm lỗ 4.192 tỷ đồng, giảm khấu trừ 137 tỷ đồng.
Năm 2014, số lượng doanh nghiệp được cơ quan thuế thanh, kiểm tra tăng lên, với số lượng là 67.053. Qua đó, tổng số thuế tăng thu qua thanh tra, kiểm tra là 12.224 tỷ đồng, trong đó truy thu là 8.022 tỷ đồng, truy hoàn 379 tỷ đồng, xử phạt là 2.920 tỷ đồng.
Ngành Thuế cũng thanh tra, kiểm tra 3.661 doanh nghiệp lỗ, doanh nghiệp có dấu hiệu chuyển giá và doanh nghiệp có hoạt động giao dịch liên kết, giảm lỗ 7.503 tỷ đồng; truy thu, truy hoàn và phạt 2.045 tỷ đồng.
Như vậy, sau 3 năm từ năm 2012 đến 2014, ngành Thuế đã thanh tra, kiểm tra 7.932 doanh nghiệp có giao dịch liên kết, có dấu hiệu chuyển giá.
