Theo quyết định, việc thanh tra diễn ra sau khi Phó thủ tướng Trương Hòa Bình có chỉ đạo về việc thanh tra lại việc giao đất, quá trình cho phép đầu tự dự án bằng hình thức BT, dùng quỹ đất sân bay Nha Trang. Thời hạn thanh tra là 40 ngày, kể từ ngày công bố quyết định thanh tra.
Đoàn thanh tra do ông Phùng Xuân Kiên, Phó cục trưởng Cục II Thanh tra Chính phủ làm trưởng đoàn. Ngoài ra, đoàn còn có 2 phó trưởng đoàn và 6 thành viên. Đoàn công tác có nhiệm vụ thanh tra theo nội dung và kế hoạch thanh tra được phê duyệt, báo cáo Tổng Thanh tra Chính phủ về kết quả làm việc.
Trước đó, ngày 28/10/2016, UBND tỉnh Khánh Hoà đã ban hành Quyết định số 3262/QĐ-UBND về việc thu hồi hơn 62,3ha đất tại khu vực sân bay Nha Trang cũ để giao cho Công ty Cổ phần Tập đoàn Phúc Sơn thực hiện dự án khu trung tâm đô thị - dịch vụ - tài chính - du lịch Nha Trang.
Đến ngày 25/7/2017, UBND tỉnh Khánh Hoà đã ra Quyết định 2139/QĐ-UBND sửa đổi nội dung quan trọng tại điều 1 và 2 của Quyết định số 3262.
Theo đó, khoản 2 điều 1 được sửa đổi như sau: “Giao toàn bộ diện tích đất 623.064m2 đất (gồm 632.022m2 đất đã thu hồi của Quyết định 3262/QĐ-UBND tỉnh Khánh Hoà và 42,1m2 đất do UBND phường Lộc Thọ quản lý) để hoàn vốn dự án BT (3 dự án giao thông) cho Tập đoàn Phúc Sơn làm dự án khu trung tâm đô thị - dịch vụ - tài chính - du lịch Nha Trang (phân khu 2A, 2 và 3)”.
Sau 1 năm giao đất, tháng 11/2017, UBND tỉnh mới ủy quyền cho Ban quản lý dự án của tỉnh ký hợp đồng BT 3 dự án giao thông với Tập đoàn Phúc Sơn gồm: dự án BT Nút giao thông Ngọc Hội đổi 5,49ha đất sân bay, với tổng trị giá sử dụng đất tạm tính là 1.215 tỷ đồng.
Dự án BT đường vành đai kết nối nút giao thông Ngọc Hội - còn gọi là đường vành đai 2, đổi 9,15ha đất sân bay, có tổng trị giá đất tạm tính khoảng 1.099 tỷ đồng.
Còn dự án BT nút giao thông kết nối khu sân bay Nha Trang, đổi gần 6ha đất, với giá trị đất tạm tính gần 950 tỷ đồng.
Cả 3 dự án BT có tổng mức đầu tư trên 3.562 tỷ đồng đều không qua đấu giá mà được chỉ định thầu giao cho Tập đoàn Phúc Sơn.
Liên quan đến 3 dự án BT này, ngày 1/2/2018, UBND tỉnh Khánh Hòa có Quyết định số 369 điều chỉnh, bổ sung Quyết định số 2139, trong đó giao toàn bộ 62,3ha cho Tập đoàn Phúc Sơn để quản lý, đầu tư xây dựng cơ sở hạ tầng, sử dụng đất để thực hiện dự án Khu trung tâm đô thị Thương mại – Dịch vụ – Tài chính – Du lịch Nha Trang tại phân khu 2, 3 và 2A – phân theo thỏa thuận ghi tại 3 hợp đồng BT kể trên.
Quyết định nêu rõ: “Nhà đầu tư không được phép chuyển nhượng, kinh doanh khi chưa đủ điều kiện theo quy định Luật Đất đai, Luật Kinh doanh bất động sản, Luật Đầu tư, Luật Nhà ở…”.
Tuy nhiên, khi các dự án BT của Tập đoàn Phúc Sơn vẫn chưa hoàn thành thì phần đất đối ứng làm các dự án BT tại sân bay Nha Trang cũ đã được phân lô rao bán rầm rộ từ năm 2016 và hiện đã bán gần hết.
Liên quan đến phạm tại dự án này, Ủy ban Kiểm tra Trung ương kết luận Ban Thường vụ Tỉnh ủy và Ban cán sự Đảng UBND tỉnh Khánh Hòa thiếu trách nhiệm, buông lỏng lãnh đạo, chỉ đạo, thiếu kiểm tra, giám sát, để xảy ra nhiều vi phạm, khuyết điểm nghiêm trọng trong công tác quản lý, sử dụng đất và thực hiện các dự án đầu tư xây dựng... làm thất thoát lớn tài sản của nhà nước.
