Các sân bay bị tạm dừng khai thác gồm: sân bay Chu Lai đóng cửa từ 09h00 ngày 14/11 đến 10h00 ngày 15/11; sân bay Đà Nẵng đóng cửa từ 12h00 ngày 14/11 đến 10h00 ngày 15/11; sân bay Phú Bài đóng cửa từ 14h00 ngày 14/11 đến 10h00 ngày 15/11; sân bay Đồng Hới: đóng cửa từ 19h00 ngày 14/11 đến 20h00 ngày 15/11; sân bay Vinh đóng cửa từ 06h00 ngày đến 20h00 ngày 15/11.
Ngoài việc đóng cửa 5 sân bay trên, Cục Hàng không cũng yêu cầu các cơ quan, đơn vị tổ chức trực 24/24 giờ theo Quy chế trực ban phòng, chống thiên tai trong ngành hàng không dân dụng.
Tổng công ty Quản lý bay Việt Nam được yêu cầu chỉ đạo các cơ sở cung cấp dịch vụ khí tượng hàng không tăng cường công tác đảm bảo chất lượng thông tin khí tượng; liên tục theo dõi tình hình thời tiết trong khu vực trách nhiệm, cập nhật các bản tin dự báo, cảnh báo; cung cấp đầy đủ kịp thời thông tin quan trắc, dự báo, cảnh báo tới người dùng.
Cục Hàng không yêu cầu các cảng hàng không, các hãng hàng không, các cơ sở cung cấp dịch vụ bảo đảm hoạt động bay tăng cường công tác phối hợp; theo dõi chặt chẽ diễn biến của bão để điều chỉnh kế hoạch hoặc thay đổi lịch bay tại một số địa phương có ảnh hưởng trực tiếp của cơn bão số 13 và đảm bảo an toàn tuyệt đối hoạt động bay.
Đi liền với đó là chủ động phòng chống, rà soát, thống kê các trang thiết bị, chằng néo, neo đậu tàu bay tại cảng hàng không, đảm bảo công tác bay an toàn trong mọi tình huống và có biện pháp bảo vệ công trình nhà ga, kho hàng… để hạn chế thiệt hại do bão gây ra.
Ngoài ra, các đơn vị cần triển khai phương án phòng chống mưa, bão, các biện pháp phòng chống ngập úng, khơi thông dòng chảy trong cảng hàng không, sân bay, bảo vệ cho các công trình, phương tiện, thiết bị tại cảng hàng không, hạn chế thiệt hại do mưa, bão gây ra đến mức thấp nhất và nhanh chóng ổn định mọi hoạt động hàng không phục vụ các nhu cầu của hành khách.
Theo Cục Hàng không, bão số 13 được dự đoán di chuyển hướng tây cho tới khi cách bờ biển Việt Nam khoảng 250km, sau đó chuyển hướng tây tây bắc, tiếp cận bờ Trung và Bắc Trung bộ rồi vào bờ ở khu vực Quảng Trị - Quảng Bình trong sáng ngày 15/11.
Dự báo các cảng hàng không bị ảnh hưởng trực tiếp thời tiết bão: Chu Lai, Đà Nẵng, Phú Bài, Đồng Hới, Vinh. Các cảng hàng không bị ảnh hưởng gián tiếp bao gồm: Phù Cát, Thọ Xuân.
Các tuyến đường hàng không khu vực phía bắc FIR HCM và phân khu 3, 4 FIR Hà Nội có thể bị ảnh hưởng do mây CB, nhiễu động mạnh, dông, sét, đóng băng trong khu vực ảnh hưởng của bão...
