Năm bị can bị đề nghị truy tố gồm Nguyễn Chí Hiến, cựu Phó Chủ tịch thường trực UBND tỉnh; Nguyễn Thị Nở, cựu Phó giám đốc Sở Tài chính; Ngô Quang Phú, cựu Phó giám đốc Sở Tài nguyên- Môi trường; Mai Hắc Lợi, cựu Phó giám đốc Sở Tư pháp; Nguyễn Ngọc Duy, cựu Cục phó Cục Thuế Phú Yên.
Theo kết luận điều tra, tháng 5/2016, Hội đồng Nhân dân tỉnh Phú Yên phê duyệt chủ trương đầu tư dự án đầu tư hạ tầng kỹ thuật khu đô thị mới Nam TP. Tuy Hòa giai đoạn 1 (dự án Nam Tuy Hòa) với diện tích hơn 54,7 ha đất. Tỉnh đầu tư gần 319 tỷ đồng xây dựng hạ tầng, bán đấu giá quyền sử dụng đất ở.
Dù dự án đang triển khai, chưa hoàn thành nhưng tháng 10/2016, ông Nguyễn Chí Hiến, Phó Chủ tịch thường trực UBND tỉnh ký quyết định thành lập Hội đồng đấu giá quyền sử dụng đất khu dân cư phía bắc của khu đô thị mới Nam TP. Tuy Hòa do ông làm chủ tịch.
Ngày 31/10/2016, UBND tỉnh phê duyệt giá đất khởi điểm để đấu giá 468 lô đất thuộc khu đô thị mới Nam TP. Tuy Hòa (giai đoạn 1) với tổng diện tích hơn 159.500 m2, tổng giá trị khu đất hơn 784 tỷ đồng. Trong đó, khu 262 lô nhà ở liền kề có giá khởi điểm 160 tỷ đồng.
Tháng 11/2016, ông Hiến ký gửi thường trực Tỉnh ủy, thường trực Hội đồng Nhân dân tỉnh xin ý kiến thực hiện chính sách ưu đãi đối với nhà đầu tư trúng đấu giá quyền sử dụng đất khu đô thị mới Nam TP. Tuy Hòa. Trong đó, đề nghị hỗ trợ cho nhà đầu tư trúng đấu giá 5% trên tổng giá trị khu đất theo giá khởi điểm đưa ra đấu giá là hơn 39 tỷ đồng. Việc này nhằm thu hút các doanh nghiệp, nhà đầu tư tham gia đấu giá mua toàn bộ 468 lô đất để thực hiện bán lẻ từng căn hộ. Sau đó, tỉnh đưa ra bán đấu giá 468 lô đất nhưng không có người tham gia.
Đến tháng 3/2017, ông Hiến chủ trì cuộc họp, kết luận chia thành bốn khu đất để bán đấu giá. Ông Hiến cũng chỉ đạo bỏ nội dung năng lực tài chính của người tham gia đấu giá. Sau đó, ông Hiến chỉ đạo đưa 262 lô đất nhà ở liền kề ra bán đấu giá; đồng thời chỉ đạo đưa nội dung hỗ trợ 5% trên tổng giá trị khu đất theo giá khởi điểm cho người trúng đấu giá vào phương án đấu giá.
Tại phiên bán đấu giá hồi tháng 5/2017, bà Ngô Thị Điều, Chủ tịch HĐQT Công ty CP Phát triển đầu tư xây dựng và du lịch An Phú Thịnh (có trụ sở tại TP. Quy Nhơn, tỉnh Bình Định) đã mua toàn bộ 262 lô nhà ở liên kế với giá trúng đấu giá 162,4 tỷ đồng, cao hơn giá khởi điểm chỉ 1,6 tỷ đồng, tương đương gần 1%.
Theo có quan điều tra, sau khi giảm 5%, giá 262 lô đất chỉ còn 154 tỷ đồng, thấp hơn giá khởi điểm 6 tỷ đồng. Tuy nhiên, Hội đồng bản đấu giá không báo cáo kết quả cuộc bán đấu giá cho UBND tỉnh theo quy định mà ký biên bản xác định bà Điều là người trúng đấu giá.
Cơ quan điều tra xác định dù phương án đấu giá sai quy định nhưng ngày 6/6/2017 ông Hiến ký quyết định công nhận kết quả đấu giá cho bà Điều, trong đó có có nội dung hỗ trợ cho người trúng đấu giá 5% trên tổng giá trị khu đất theo giá khởi điểm, tương đương hơn 8 tỷ đồng.
Đến ngày 12/9/2017, bà Ngô Thị Điều nộp đủ tiền và được cấp 262 giấy chứng nhận quyền sử dụng đất. Sau khi trúng đấu giá, bà Điều không xây dựng căn hộ để bán lẻ theo chính sách hỗ trợ mà chuyển nhượng đất nền cho người khác để kiếm lời.
Đến ngày 14/9/2020 đã bán toàn bộ 262 lô đất nêu trên với tổng số tiền hơn 328 tỷ đồng, bà Điều hưởng chênh lệch 168 tỷ đồng.
Liên quan đến vụ án trên, Cơ quan Cảnh sát Điều tra Công an tỉnh Phú Yên kiến nghị xử lý về mặt Đảng, hành chính đối với nhiều cán bộ khác: ông Trần Quốc Khánh, Phó chánh Thanh tra tỉnh; ông Đỗ Trần Chương, cựu Phó trưởng Ban Quản lý khu kinh tế Phú Yên; bà Trần Hoàng Thanh Quế, Phó giám đốc Sở Tài chính; ông Nguyễn Trọng Cường, cựu Phó giám đốc Sở Xây dựng; ông Nguyễn Lương Sinh, cựu Phó chủ tịch UBND TP. Tuy Hòa; ông Nguyễn Như Thức, cựu Giám đốc Sở Tài nguyên - Môi trường; ông Công Văn Lãnh, Phó cục trưởng Cục Thuế Phú Yên; ông Nguyễn Trọng Hòa An, Giám đốc Trung tâm Phát triển quỹ đất, Sở Tài nguyên - Môi trường.
