Theo đó, các bị cáo trong vụ án gồm: Tất Thành Cang (cựu Phó Bí thư Thường trực Thành ủy TP. HCM); Phạm Văn Thông và Phan Thanh Tân (cùng là cựu Phó Chánh Văn phòng Thành ủy TP. HCM); Huỳnh Phước Long (cựu Trưởng Phòng Quản lý đầu tư kinh doanh vốn, Văn phòng Thành ủy); Trần Công Thiện (cựu Tổng Giám đốc Công ty Tân Thuận), Nguyễn Văn Minh (cựu Chủ tịch HĐTV Công ty Tân Thuận), Trần Tấn Hải (cựu Phó Tổng giám đốc Công ty Tân Thuận), Nguyễn Thị Ngọc Bích (cựu kế toán trưởng Công ty Tân Thuận), Nguyễn Hoàng Việt (cựu kiểm soát viên Công ty Tân Thuận), Nguyễn Xuân Tùng (cựu Trưởng phòng Kinh doanh tổng hợp Công ty Tân Thuận).
Theo cáo trạng, tháng 11/2000, Công ty Tân Thuận (có vốn nhà nước) được UBND huyện Nhà Bè (TP. HCM) giao nhiệm vụ đầu tư xây dựng dự án Phước Kiển, được Văn phòng Thành ủy chấp thuận chủ trương đầu tư.
Tháng 8/2016, Công ty CP Quốc Cường Gia Lai có văn bản đề nghị hợp tác đầu tư với tỉ lệ 75/25 hoặc xin nhận chuyển nhượng 100% dự án Phước Kiển. Thời điểm này, ông Trần Công Thiện (Tổng Giám đốc Công ty Tân Thuận) đã chỉ đạo cấp dưới thuê Công ty Kiểm toán và Dịch vụ tin học TP. HCM ban hành chứng thư thẩm định giá xác định diện tích 32ha đất tại dự án trên có giá bình quân là hơn 1 triệu đồng/m2.
Hội đồng xây dựng giá bất động sản kinh doanh của Công ty Tân Thuận sau đó họp và chỉ căn cứ duy nhất vào giá trong chứng thư thẩm định giá (1,25 triệu đồng/m2) để xây dựng đơn giá chuyển nhượng.
Tháng 6/2017, Công ty Tân Thuận đã chuyển nhượng 32ha đất Phước Kiển cho Công ty Quốc Cường Gia Lai với giá 1,29 triệu đồng/m2, nhận 374 tỷ đồng, tiền thuế VAT là 23 tỷ đồng. Sau đó, hợp đồng bị hủy bỏ, Công ty Tân Thuận đã trả lại cho Công ty Quốc Cường Gia Lai 374 tỷ đồng, 23 tỷ đồng tiền thuế VAT và 21 tỷ đồng tiền lãi, gây thiệt hại 215,5 tỷ đồng của nhà nước.
Đối với 32.967m2 đất thuộc Khu IV - dự án Khu dân cư Ven Sông tại phường Tân Phong (quận 7), Công ty Tân Thuận cũng căn cứ vào chứng thư thẩm định giá của Công ty Thương Tín, trong đó xác định giá trị bình quân khu đất này là hơn 17,6 triệu đồng/m2.
Ngày 28/11/2017, Công ty Tân Thuận chuyển nhượng toàn bộ khu đất này cho Công ty Quốc Cường Gia Lai với giá 20 triệu đồng/m2, gây thiệt hại cho Nhà nước hơn 283 tỷ đồng. Tổng thiệt hại vụ án này là hơn 498,5 tỷ đồng.
Hội đồng xét xử cũng quyết định triệu tập đại diện Công ty Cổ phần Quốc Cường Gia Lai, Văn phòng Thành ủy TP. HCM, Công ty Tân Thuận và 4 cá nhân tham gia phiên tòa với tư cách tố tụng là người có nghĩa vụ và quyền lợi liên quan.
