Nghị quyết này quy định thí điểm một số cơ chế, chính sách đặc thù phát triển TP. HCM về quản lý đầu tư; tài chính, ngân sách nhà nước; quản lý đô thị, tài nguyên, môi trường; ngành, nghề ưu tiên thu hút nhà đầu tư chiến lược vào TP; quản lý khoa học và công nghệ, đổi mới sáng tạo; tổ chức bộ máy của chính quyền TP và TP. Thủ Đức.
Về quản lý đầu tư, Nghị quyết cho phép HĐND TP. HCM quyết định bố trí vốn đầu tư công để hỗ trợ giảm nghèo, giải quyết việc làm thông qua việc giao UBND TP ủy thác cho Ngân hàng Chính sách xã hội chi nhánh TP. HCM thực hiện chính sách cho vay hỗ trợ hộ nghèo, hộ cận nghèo, hộ mới thoát nghèo, giải quyết việc làm.
TP. HCM được thí điểm mô hình phát triển đô thị theo định hướng phát triển giao thông công cộng (TOD); được tổ chức đấu thầu lựa chọn nhà đầu tư thực hiện dự án có sử dụng đất.
Về các dự án đầu tư theo phương thức đối tác công tư (PPP), ngoài các lĩnh vực đầu tư theo phương thức đối tác công tư quy định tại Luật Đầu tư, Thành phố được áp dụng đầu tư theo phương thức đối tác công tư đối với các dự án đầu tư trong lĩnh vực thể thao và văn hóa.
Thành phố được áp dụng loại hợp đồng xây dựng - vận hành - chuyển giao (sau đây gọi là hợp đồng BOT) đối với dự án đầu tư xây dựng nâng cấp, mở rộng, hiện đại hóa công trình đường bộ hiện hữu, phù hợp theo quy hoạch được phê duyệt đối với loại đường phố chính đô thị, đường trên cao.
Về tài chính, ngân sách nhà nước, HĐND TP HCM được quyết định áp dụng trên địa bàn mức phí, lệ phí chưa được quy định trong Danh mục phí, lệ phí ban hành kèm theo Luật Phí và lệ phí; điều chỉnh mức hoặc tỉ lệ thu phí, lệ phí đã được cấp có thẩm quyền quyết định đối với các loại phí, lệ phí được quy định trong Danh mục phí, lệ phí ban hành kèm theo Luật Phí và lệ phí, trừ án phí, lệ phí Tòa án và các loại phí thuộc nguồn thu của ngân sách trung ương hưởng 100%;
Về quản lý đô thị, tài nguyên, môi trường, TP HCM được thực hiện một số cơ chế, chính sách đặc thù trong việc chuyển mục đích sử dụng đất trồng lúa dưới 500 ha. Bên cạnh đó là các cơ chế về thực hiện đầu tư các dự án nhà ở xã hội.
UBND TP xây dựng, trình HĐND TP thông qua và ban hành hệ số điều chỉnh giá đất phù hợp với tình hình thực tiễn của TP để áp dụng tính tiền sử dụng đất, tiền thuê đất đối với tất cả các khu đất, thửa đất (không phân biệt giá trị tính theo bảng giá đất) trong trường hợp bảng giá đất đã thu thập thông tin thị trường và xây dựng đến từng thửa đất để áp dụng
Đối với dự án áp dụng loại hợp đồng BT được ký kết theo đúng quy định của pháp luật tại thời điểm ký kết hợp đồng BT trước ngày Luật Đầu tư theo phương thức đối tác công tư có hiệu lực thi hành mà chưa hoàn thành việc thanh toán cho nhà đầu tư thì việc sử dụng quỹ đất do Nhà nước quản lý thuộc trường hợp sắp xếp lại, xử lý tài sản công để thanh toán cho nhà đầu tư
Nghị quyết cũng quy định các cơ chế, chính sách đặc thù về việc thực hiện thu hồi đất của một số dự án tại TP; Việc kiểm soát khí thải phương tiện giao thông.
Về ngành, nghề ưu tiên thu hút nhà đầu tư chiến lược vào TP, Nghị quyết đã quy định danh mục ngành, nghề ưu tiên thu hút nhà đầu tư chiến lược. Quy định các nhà đầu tư chiến lược sẽ được hưởng ưu đãi về thuế, về thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất nhập khẩu. Nghị quyết cũng nêu rõ các nghĩa vụ của nhà đầu tư chiến lược.
Về quản lý khoa học và công nghệ, đổi mới sáng tạo, Nghị quyết đưa ra các cơ chế, chính sách đặc thù về miễn thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế thu nhập cá nhân...
Bên cạnh đó, khu công nghệ cao, khu công nghệ thông tin tập trung, trung tâm đổi mới sáng tạo trên địa bàn TP được thử nghiệm có kiểm soát các giải pháp công nghệ mới trong phạm vi khu.
Về tổ chức bộ máy chính quyền của TP, Nghị quyết cho phép HĐND TP thành lập Sở An toàn thực phẩm là cơ quan chuyên môn thuộc UBND TP. UBND huyện thuộc TP có không quá 3 phó chủ tịch. Đối với phường, xã, thị trấn có quy mô dân số từ 50.000 người trở lên thì UBND dân phường, xã, thị trấn có không quá 3 phó chủ tịch.
