Tổ hợp khách sạn căn hộ cao cấp Mường Thanh Khánh Hòa được Sở Xây dựng Khánh Hòa cấp phép xây dựng từ ngày 30/10/2014, trong đó cho phép chủ đầu tư xây dựng căn hộ chung cư tại dự án này.
Theo quy định tại Nghị định 17 ngày 23/6/2010, mọi trường hợp mua bán căn hộ tại dự án, chủ đầu tư phải thông báo cho Sở Xây dựng trước khi thực hiện. Tuy nhiên, kể từ khi được cấp giấy phép xây dựng, chủ đầu tư không có văn bản thông báo cho Sở Xây dựng về việc mua bán căn hộ tại dự án trên.
Sở Xây dựng lý giải, ngày 17/6/2015, UBND tỉnh có công văn về việc thỏa thuận điều chỉnh kiến trúc quy hoạch dự án Tổ hợp khách sạn căn hộ cao cấp Mường Thanh Khánh Hòa, trong đó điều chỉnh chỉ tiêu kiến trúc quy hoạch. Theo đó, dự án này không còn là dự án phát triển nhà ở, dự án đầu tư xây dựng nhà ở theo Luật Nhà ở. Vì thế, mọi trường hợp mua bán căn hộ trước ngày 17/6/2015 là bất hợp pháp vì không tuân thủ quy định tại Nghị định số 17 của Chính phủ.
Đến ngày 20/10/2015, Sở Xây dựng mới cấp phụ lục điều chỉnh giấy phép xây dựng, trong đó điều chỉnh giấy phép xây dựng của dự án thành đầu tư xây dựng 41 tầng khối tháp tổ chức các chức năng gồm 250 phòng khách sạn và 944 căn hộ du lịch và kỹ thuật áp mái. Như vậy, mọi hành vi mua bán căn hộ từ ngày 17/6/2015 đến 20/10/2015 là bất hợp pháp vì dự án chưa được cấp giấy phép xây dựng phù hợp với chủ trương đầu tư mới (là đầu tư căn hộ du lịch thay cho đầu tư căn hộ chung). Đặc biệt, trong thời gian này chủ đầu tư vẫn không thông báo việc bán căn hộ cho Sở Xây dựng.